Το Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών λειτουργεί τα παρακάτω Προγράμματα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) τα οποία έχουν εγκριθεί από το Υπ.ΠΕΘ σύμφωνα με το Ν.4485/2017:
καθώς επίσης και τα εξής Διατμηματικά/Διιδρυματικά ΠΜΣ στα οποία το Τμήμα είναι επισπεύδον και τα οποία έχουν εγκριθεί από το Υπ.ΠΕΘ σύμφωνα με το Ν.4485/2017: